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Análisis e Interpretación de datos ‘ómicos’

Análisis e Interpretación de datos ‘ómicos’

Descripción:

Esta asignatura presenta una visión actualizada del campo de la genómica y transcriptómica desde una perspectiva bioinformática aplicada a la salud. Se busca transmitir a los alumnos el estado actual del campo, especialmente en el contexto de las nuevas tecnologías de secuenciación masiva, y sus implicaciones metodológicas y analíticas en bioinformática. Los alumnos aprenderán, de manera teórica y práctica, qué herramientas han de usar para manejar conjuntos de secuencias procedentes de estas tecnologías, explorar y usar datos genómicosy transcriptómicos  obtenidos de bases de datos públicas.

Docentes

Nombre Afiliación
Joaquín Dopazo – Coordinador Fundación Progreso y Salud
Fátima Al-shahrour CNIO
Jose Luis García CIB-CSIC
Osvaldo Graña CNIO
Gonzalo Gómez López CNIO
Elena Piñero CNIO
Javier Perales CNIO
Hafid Laayouni El Alaoui UPF
María Rigau BSC
Núria Malats CNIO
Laura Furlong IMIM
María Peña CIPF
Francisco García CIPF
Marta Hidalgo FPS
Pablo Mínguez FJD
Héctor Tejero CNIO
Enrique Carrillo de Santa Pau IMDEA Alimentación
Val Fernández IRYCIS

Programa

Tema 1.- Introducción a la Secuenciación

Tema 2.- Introducción al análisis transcriptómico

Tema 3.- Análisis Supervisado – Expresión Diferencial

Tema 4.- Análsiis no Supervisado – Clustering y predictores

Tema 5.- Análsis Funcional de Datos ‘Ómicos’

Tema 6.- Interpretación Avanzada: GSEA

Tema 7.- Interpretación Avanzada: Análisis de Redes

Tema 8.- Análisis e Interpretación experimentos de RNAseq

Tema 9.- Herramientas y DDBBs genómicas médicas

Tema 10.- Alineadores y formatos de los datos

Tema 11.- Interpretación Avanzada – Análisis de Pathways

Tema 12.- Mutaciones I – Identificación de Variantes

Tema 13.- Mutaciones II – Anotación y Filtro de Variantes

Tema 14 .- Mutaciones III – Interpretación

Tema 15 .- Análisis CNVs

Tema 16 .- Priorización alteraciones en enfermedades raras

Tema 17 .- Genes y Enfermedad

Tema 18.- GWAS (Genome-Wide Association Studies)

Tema 19.- Epidemiología Molecular

Tema 20 .- Bioinformática Aplicada a Microbiología Clínica

Tema 21 .- Introducción al Análisis de Metilación

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